Les moyennes du marché disent ce que vaut une officine en général. L'audit dit ce que vaut celle-ci, et ce qu'elle cache. Il se mène entre la lettre d'intention et le compromis, avec un expert-comptable et un avocat spécialisés en officine. Voici ce qu'il doit couvrir, point par point.
Les documents à demander
La comptabilité
- les trois derniers bilans et liasses fiscales ;
- le chiffre d'affaires mois par mois sur les douze derniers mois, et depuis la dernière clôture ;
- le détail du chiffre d'affaires par famille ou par taux de TVA (médicaments remboursables, non remboursables, parapharmacie) et le montant des honoraires ;
- les marges par famille, la valeur et la rotation du stock.
Le personnel
- la liste des salariés avec leur contrat, leur ancienneté, leur coefficient et leur rémunération ;
- les congés restant dus, les heures supplémentaires, les primes ;
- les litiges en cours ou passés, et les derniers contrôles de l'Urssaf.
Les locaux et les contrats
- le bail et ses avenants, la licence de l'officine ;
- les contrats en cours : groupement, grossiste-répartiteur, logiciel de gestion officinale, crédit-bail, sécurité, assurances ;
- les registres obligatoires et les rapports des dernières inspections.
Lors d'une cession de fonds de commerce, la loi impose que l'acte vise le chiffre d'affaires mensuel réalisé depuis la dernière clôture, et que le vendeur tienne à la disposition de l'acheteur les livres comptables des trois derniers exercices pendant trois ans (article L141-2 du Code de commerce). Attention aussi : dans une cession de fonds, les contrats autres que les contrats de travail ne sont pas repris automatiquement. Dressez la liste de ceux que vous voulez conserver et prévoyez-la dans l'acte.
Les chiffres à analyser, et les repères
Les statistiques du réseau d'experts-comptables CGP sur les exercices 2025 (1 905 officines) donnent des points de comparaison utiles :
| Indicateur | Moyenne 2025 | Ce qu'il faut vérifier |
|---|---|---|
| Marge brute | 27,6 % du CA | Un écart important s'explique : médicaments chers, remises, politique de prix |
| EBE | 10,1 % du CA | C'est lui qui rembourse l'emprunt et vous rémunère |
| Frais de personnel | 10,9 % du CA, soit 39 % de la marge | Au-delà de 40 % de la marge, un seuil d'alerte souvent cité |
| Loyer | 1,3 % du CA | Un loyer hors marché pèse sur toute la durée du bail |
| Stock | 42 jours | Un surstock immobilise de la trésorerie et cache des périmés |
| Honoraires | 8,6 % du CA | Dispensation et ordonnances : une part croissante de la rémunération |
Deux lectures complémentaires. D'abord, la part des médicaments chers : ils représentent en moyenne 44 % du chiffre d'affaires remboursable selon ces mêmes statistiques, gonflent le chiffre d'affaires et dégradent le taux de marge ; une officine qui en délivre beaucoup n'est pas forcément plus rentable. Ensuite, la dépendance au remboursable : selon les moyennes KPMG publiées en 2024, environ 72 % du chiffre d'affaires d'une officine relève du taux de TVA à 2,1 % (médicaments remboursables et honoraires), et 11 % de la parapharmacie. Plus la part du remboursable est forte, plus l'officine dépend de ses prescripteurs.
Enfin, faites retraiter l'EBE : rémunération réelle du titulaire, loyers versés à une société civile immobilière du vendeur, charges exceptionnelles. C'est l'EBE retraité qui doit couvrir vos annuités d'emprunt et votre rémunération.
Les risques propres à l'officine
Les prescripteurs. Identifiez les médecins du secteur, leur âge et leurs projets. Le départ à la retraite d'un médecin non remplacé peut faire perdre une part importante de l'activité. Une maison de santé proche est un atout, à condition de savoir qui en détient les murs et quels sont ses projets.
La concurrence et le maillage. L'ouverture d'une officine par transfert ou regroupement n'est possible que dans une commune d'au moins 2 500 habitants, puis par tranche entière de 4 500 habitants supplémentaires ; le premier seuil est de 3 500 habitants en Alsace-Moselle et en Guyane (article L5125-4 du Code de la santé publique). Dans certains territoires fragiles, l'agence régionale de santé peut aussi autoriser un transfert près d'une maison de santé ou d'un centre commercial. Renseignez-vous auprès de l'ARS et du conseil régional de l'Ordre sur les demandes en cours dans la zone.
Le bail. La licence d'une officine est attachée à son emplacement (article L5125-18). Perdre le bail, c'est devoir obtenir une autorisation de transfert : le bail est donc l'élément le plus sensible du fonds. Vérifiez sa durée restante, la clause de destination, le loyer et ses révisions, les conditions de renouvellement et de cession (accord du bailleur).
Les locaux. Espace de confidentialité, lieu de préparation, stockage sécurisé des stupéfiants, accessibilité : les exigences du Code de la santé publique ont été actualisées en 2026. Faites chiffrer les travaux de mise aux normes avant de négocier.
Le personnel. Les contrats de travail en cours sont transférés de plein droit au repreneur, avec l'ancienneté des salariés (article L1224-1 du Code du travail). L'audit social vérifie la classification selon la convention collective de la pharmacie d'officine, le paiement des heures supplémentaires et des primes conventionnelles, les contentieux et la situation vis-à-vis de l'Urssaf.
Les engagements commerciaux. Durée restante et pénalités de sortie du contrat de groupement, engagements d'achat auprès d'un grossiste, contrats de logiciel et de crédit-bail : tout ce qui vous liera après la reprise.
Fonds ou parts : deux audits différents
En 2025, selon Interfimo, 57 % des cessions ont porté sur un fonds de commerce et 43 % sur des parts sociales ; sept premières installations sur dix se font par l'achat d'un fonds.
Acheter le fonds, c'est acheter l'activité sans les dettes de l'exploitant. L'audit porte sur l'activité, le bail, le personnel et les contrats. Le prix est généralement séquestré quelques mois, le temps que les créanciers du vendeur puissent se manifester.
Acheter les parts, c'est acheter la société avec tout son passé : dettes, risques fiscaux et sociaux, litiges. L'audit s'étend à l'ensemble du passif, et l'acte prévoit une garantie d'actif et de passif, généralement de l'ordre de trois ans, avec une franchise, un plafond et un séquestre ou une garantie bancaire. L'entrée d'un nouvel associé doit être agréée par l'Ordre. Le choix entre fonds et parts dépend aussi de la structure que vous retenez : voir notre guide sur les structures.
Le calendrier type
- La lettre d'intention : prix indicatif, période d'exclusivité, accès aux documents.
- L'audit, sur quelques semaines.
- Le compromis, signé sous conditions suspensives : obtention du prêt, accord du bailleur, purge du droit de préemption de la commune le cas échéant, enregistrement de votre déclaration d'exploitation par l'Ordre.
- Les démarches auprès de l'Ordre : le dossier se dépose au moins un mois avant la réunion du conseil régional, qui se tient environ une fois par mois. Comptez trois mois au minimum.
- L'acte définitif et l'entrée en jouissance, suivis des formalités : enregistrement de l'acte dans le mois, publicité légale.
Comptez en général quatre à sept mois entre le compromis et la signature définitive. Le parcours complet, de l'idée à l'ouverture, est détaillé dans notre guide des sept étapes de la reprise.
Un audit coûte peu au regard du prix d'une officine, et c'est votre meilleur argument de négociation. Le salon réunit des experts-comptables (Fiducial, Talenz) et des avocats (GSA, Emma Favre-Rochex, Adven) spécialisés dans la reprise d'officine.
Sources
- Extencia, chiffres-clés et ratios de gestion des pharmacies en 2026 (statistiques CGP)
- Le Moniteur des pharmacies, dix chiffres qui alertent derrière la hausse du chiffre d'affaires
- KPMG, moyennes professionnelles des pharmacies 2024
- Interfimo, « Prix des pharmacies en 2025 »
- Code de commerce, article L141-2 (Légifrance)
- Code de la santé publique, article L5125-4 (Légifrance)
- Code de la santé publique, article L5125-18 (Légifrance)
- Code du travail, article L1224-1 (Légifrance)
- ONPC Notaires, les cinq étapes clés d'une cession de pharmacie
- Le Moniteur des pharmacies, les formalités d'acquisition
Guide à jour au 27 septembre 2026. Cette liste de contrôle ne remplace pas l'audit d'un professionnel : chaque officine a ses particularités.